Лаборатория геносистематики

О лаборатории

Лаборатория была основана в 1991 году. Первоначально ее задача состояла в исследовании сообществ бентосных организмов Байкала. Вскоре основной фокус интересов сместился в сторону молекулярно-биологических методов и признаков, которые применяются при решении таксономических и эволюционных задач. Соответственно, использование методов молекулярной филогенетики стало все более интенсивным и разнообразным.

По мере накопления данных о полиморфизме нуклеотидных последовательностей небольшого числа генов у представителей нескольких групп организмов, появилась возможность все больше сосредоточиться на процессах, происходящих на популяционном уровне. Это позволило соотнести эволюционные процессы (видообразование и вымирание видов, а также демографические события) с подробно исследованной геологической историей Байкала. И уже в самое последнее время дальнейшее увеличение объема экспериментальных данных открыло путь к исследованию возможной эволюционной роли взаимодействий организмов друг с другом в составе сообществ. Таким образом, возвращаются вопросы, которые ставились перед лабораторией во время ее основания.

Возрастающая сложность биологических проблем и методов обработки экспериментальных данных требует бсе более и более изощренных статистических методов и инструментов понимания. Эта тенденция привела к тому, что в рамках лаборатории стало развиваться еще одно направление - компьютерное моделирование биологических процессов

amphipods

Некоторые публикации

  1. Fazalova Varvara, Bruno Nevado, Tatiana Peretolchina, Jeanna Petunina, Dmitry Sherbakov When environmental changes do not cause geographic separation of fauna: differential responses of Baikalian invertebrates. // BMC Evolutionary Biology; 2010; 10(320):1-12.
  2. Kravtsova L. S., Weinberg I. V., Khanaev I. V., Sherbakov D. Yu. , Semovsky S. V., Adov F. V. , Rozhkova N. A. , Pomazkina G.V ., Shevelyova N. G., Kaygorodova I. A. The formation of a fouling community on artificial substrate in Lake Baikal . // Hydrobiologia, Springer Netherlands; 2006; 568(1):51-55.
  3. Kaygorodova I. A. , Sherbakov D. Yu. , Martin P. Molecular phylogeny of Baikalian Lumbriculidae (Oligochaeta): evidence for recent explosive speciation. // Comparative Cytogenetics; 2007; 1(1):71-84
  4. Перетолчина Т.Е., Букин Т.Я.,Ситникова Т.Я., Щербаков Д.Ю. Генетическая дифференциация эндемичного байкальского вида Baicalia Carinata (Mollusca : Caenogastropoda). // Генетика; 2007; 43(12):1-9.
  5. Bukin Ju.S., Pudovkina T.A., Sherbakov D.Ju., Sitnikova T.Ya. Genetic Flows in a Structured One-Dimensional Population: Simulation and Real Data on Baikalian Polychaetes M. Godlewskii. // In Silico Biology ; 2007; 7(3):277-284.
  6. Дарикова Ю.А., Щербаков Д.Ю.(Darikova Yu.A., Sherbakov D.Yu.) Эволюция интрона гена фосфофруктокиназы у брюхоногих моллюсков семейства Baicalidae.(Evolution of the Phosphofructokinase Gene Introne in Gastropods of Family Baicalidae). //Молекуляр. биология; 2009; 43(5):838-844
  7. Зубаков Д.Ю., Щербаков Д.Ю., Ситникова Т.Я. Анализ филогенетических взаимоотношений байкальских эндемичных моллюсков семейства Baicaliidae, Clessin 1878 (Gastropoda, Pectinibranchia) на основе нуклеотидных последовательностей фрагмента митохондриального гена CO 1. // Молекуляр. биология; 1997; 31(6):1092-1097.
  8. Sherbakov D.Yu., Kamaltynov R.M., Ogarkov J.B., Verheyen E. Patterns of evolutionary change in Baikalian Gammaridae inferred from DNA sequences (Crustacea, Amphipoda). // Molecular Phylogeny and Evolution; 1998; 10(2):160-167
  9. Mashiko K., Kamaltynov R.M., Sherbakov D.Yu., Morino H. Genetic separation of gammarid (Eulimnogammarus cyaneus) populations in Lake Baikal. // Biodiversity, Phylogeny and Environmental in Lake Baikal; 1999;67-79
  10. Sherbakov D.Yu. Molecular phylogenetic studies on the origin of biodiversity in Lake Baikal. // Trends in Ecology & Evolution; 1999; (14):92-94
  11. Martin P., Kaygorodova I., Sherbakov D.Yu., Verheyen E. Rapidly evolving lineages impede the resolution of phylogenetic relationships among Clitellata (Annelida). // Mol. Phylogen. Evol.; 2000; 15(3):355-368.
  12. Semovski S.V.,Bukin Yu.S., Sherbakov D.Yu. Speciation in one-dimensional population : adaptive dynamics and neutral molecular evolution. // Electronic jornal ' Investigated in Russia'; 2002; 125e():1397-1402.
  13. Hidding B., Michel E., Natyaganova A.V., Sherbakov D.Yu. Molecular evidence reveals a polyphyletic origin and chromosomal speciation of Lake Baikal's endemic asselid isopods. // Molecular Ecology ; 2003; (12):1509-1514.
  14. Papusheva E. P. , Sherbakov D.Yu., Sitnikova T. Ya. , Zubakov D.Yu., Blinov A.G., Starobogatov Ya.I. Molecular phylogeny of the genus Choanomphalus (Pulmonata: Planorbidae). // Ruthenica; 2003; 13(1):75-80
  15. Stift M., Michel El., Sitnikova T., Mamonova E., Sherbakov D. Palaeartic gastropod gains a foothold in the dominion of endemics : range expansion and morphological change of Lymnaea (Radix) auricularia in Lake Baikal. //J. Hydrobiology; 2004; (513):101-108